系统性红斑狼疮目前没有根治的方法。治疗原则强调早期诊断，早期治疗以及个体化的治疗方案，以及联合用药。早期诊断，早期治疗十分重要，可以避免和延缓不可逆的组织脏器的病理损害，改善系统性红狼疮的预后。对明确诊断的患者应当进行疾病活动度的评估，判断疾病的轻重程度，对中重度的狼疮治疗通常分为两个阶段，即诱导缓解和维持治疗。
同时必须对患者进行宣教，使其正确的认识疾病，消除恐惧心理，明白规律用药的意义，懂得长期随访的必要性，避免过度的紫外线的照射，以及不恰当的妊娠和药物使用，防止诱发加重狼疮。同时要防止感染，尽可能做到达标治疗。